Magistarski znanstveni rad je izvorno, originalno djelo koje magistrand samostalno izrađuje, u suradnji i pod vodstvom mentora, na kraju poslijediplomskog magistarskog znanstvenog studija, a koje je po metodologiji obrade i doprinosu znanosti prikladno za utvrđivanje magistrandove sposobnosti za aktivno sudjelovanje u znanstvenoistraživačkom radu, u znanstvenom području i polju znanosti za koje se podjeljuje magisterij znanosti.

Istraživanje tematike, koja se tretira u okviru problema i predmeta istraživanja i postavljene hipoteze, mora se provoditi fundamentalnim i primijenjenim istraživanjima, ali uz primjenu petnaestak i više znanstvenih metoda u odgovarajućim kombinacijama. Rezultatima istraživanja koji se prezentiraju u magistarskom znanstvenom radu, slično doktorskoj disertaciji, moraju se otkriti nove spoznaje, nove znanstvene činjenice, nove zakonitosti, nove teorije (...). To je, u pravilu, izrazito samostalno izrađeno djelo i ono ne može biti rezultat timskog rada.

Izradom magistarskog znanstvenog rada magistrand mora dokazati: 1) sposobnost primjene teorijskog i praktičnog znanja u samostalnoj obradi aktualne i do tada neobrađene teme (i tematike) znanstvenih i stručnih djela, 2) sposobnost primjene metodologije i tehnologije znanstvenog istraživanja, 3) sposobnost korištenja relevantnih tuđih spoznaja, stavo va, znanstvenih činjenica, zakonitosti, teorija koje su objavljene u aktualnoj literaturi ili su pohranjene u bankama podataka, 4) sposobnost formuliranja rezultata istraživanja i vlastitih spoznaja do kojih je došao primjenom znanstvenoistraživačkog instrumentarija i tijekom znanstvenoistraživačkog rada, 5) sposobnost pisanja tekstova znanstvenih i stručnih djela i 6) sposobnost da aktivno i učinkovito sudjeluje, individualno ili kolektivno, u znanstvenoistraživačkom radu.

Magistarski rad ima određenu i preciznu srtrukturu i međusobnu povezanost svih dijelova. Kao uputstvo za izradu magistarskog rada neophodno je u cijelosti koristiti knjigu prof. dr. Ratko Zelenika „Metodologija i tehnologija izrade znanstvenog i stručnog djela“, izdanje Ekonomski fakultet Rijela, 2000. Godine, a naročito dio knjige koji se odnosi na sticanje magisterija znanosti str. 588 – 624.

Procedure prijave, ocjene i odbrane magistarskog rada su precizirane Pravilima studiranja II
ciklusa (magistarskog studija).
Prijava magistarskog rada (član 25. i 26. navedenih Pravila studiranja) obuhvata:

1. Biografiju kandidata
2. Naziv teme
3. Struktura rada
4. Obrazloženje
4.1. Obrazloženje naziva rada
4.2. Predmet istraživanja
4.3. Svrha i cilj istraživanja
4.4. Metode koje će biti primjenjene
4.5. Sadržaj rada
4.6. Popis osnovne literature

Zahtjev za ocjenu magistarskog rada (član 29. navedenih Pravila studiranja) sadrži:

1. Prijavu
2. Pismenu suglasnost mentora da rad ispunjava kriterije navedene u obrazloženju teme.
3. Pet primjeraka rada (neukoričena) i jedan primjerak u elektronskoj formi
4. Izvještaj iz službe evidencije o ispitima i ECTS bodovima kandidata.

Ostale procedure i procesi oko magistraskog rada (izbor mentora, izbor komisija, procedura odbrane precizirane su Pravilima studiranja).